有人在做cancer biomarker discovery 的吗？

markero

最近想往这个方向做一下，想用system biology/bioinformatics 的方法去分析。
有人在做这个方向吗？进来讨论一下吧。

orionsnow

i am interested in system biology.

i do biomarker discovery and gene mapping,  but not for cancer.

markero

There are many definitions and classifications of biomarkers.
What kind of biomarker is yours?

原帖由 orionsnow 于 2008-10-27 15:36 发表
i am interested in system biology.
i do biomarker discovery and gene mapping,  but not for cancer.

[ 本帖最后由 markero 于 2008-10-27 17:03 编辑 ]

orionsnow

We try to use SNP in the future.  

But now we just use general QTL to do gene mapping. Then make prediction for the yield of plants.



sorry I cannot input chinese now,    I will describe some after i go home.

sandykaka

飘过 抑癌基因进行中

lagrandeur

我现在也在用生物信息的方法分析SNP数据。其实同样的方法用到分析其他类型的数据也没问题。如果是简单的分类，那么有好多聚类的方法可以用；如果是要做网络，也有bayesian network可以尝试。:)

markero

这是我准备在浙大做的方向，也许我们将来可以合作一下。

原帖由 lagrandeur 于 2008-11-18 02:32 发表
我现在也在用生物信息的方法分析SNP数据。其实同样的方法用到分析其他类型的数据也没问题。如果是简单的分类，那么有好多聚类的方法可以用；如果是要做网络，也有bayesian network可以尝试。:)